Obsidian хранит глобальные свои настройки в системной папке:

  • macOS/Users/yourusername/Library/Application Support/obsidian или ~/Library/Application Support/obsidian
  • Windows%APPDATA%\Obsidian\
  • Linux$XDG_CONFIG_HOME/Obsidian/ или ~/.config/Obsidian/

Для полного сброса всех глобальных настроек Obsidian (настройки конкретных хранилищ останутся без изменений, так как хранятся в них самих) надо закрыть приложение Obsidian, перейти в системную папку, указанную выше, и удалить в ней все файлы.

На примере  macOS:

osascript -e 'quit app "Obsidian"'
cd ~/Library/Application\ Support/obsidian
rm -r * .*